Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms