Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Tnfsf18Q7TS55 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Tnfsf18Q7TS55 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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