Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Sys1Q78S06 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Sys1Q78S06 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Sys1Q78S06 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Sys1Q78S06 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Sys1Q78S06 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Sys1Q78S06 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Sys1Q78S06 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Sys1Q78S06 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Sys1Q78S06 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Sys1Q78S06 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Sys1Q78S06 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Sys1Q78S06 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sys1Q78S06 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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