Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY3

Rps27l, 40S ribosomal protein S27-like, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27lQ6ZWY3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps27lQ6ZWY3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps27lQ6ZWY3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Rps27lQ6ZWY3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27lQ6ZWY3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27lQ6ZWY3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27lQ6ZWY3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27lQ6ZWY3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27lQ6ZWY3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27lQ6ZWY3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27lQ6ZWY3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27lQ6ZWY3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27lQ6ZWY3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27lQ6ZWY3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27lQ6ZWY3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms