Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Ssxb10Q6XAR7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Ssxb10Q6XAR7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Ssxb10Q6XAR7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Ssxb10Q6XAR7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb10Q6XAR7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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