Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Cxcl3Q6W5C0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcl3Q6W5C0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms