Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms