Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms