Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms