Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smchd1Q6P5D8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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