Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpbp1l1Q6NZP2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms