Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SphkapQ6NSW3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SphkapQ6NSW3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SphkapQ6NSW3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SphkapQ6NSW3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SphkapQ6NSW3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SphkapQ6NSW3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SphkapQ6NSW3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SphkapQ6NSW3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SphkapQ6NSW3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SphkapQ6NSW3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SphkapQ6NSW3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SphkapQ6NSW3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SphkapQ6NSW3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SphkapQ6NSW3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SphkapQ6NSW3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SphkapQ6NSW3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SphkapQ6NSW3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SphkapQ6NSW3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SphkapQ6NSW3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SphkapQ6NSW3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SphkapQ6NSW3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SphkapQ6NSW3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SphkapQ6NSW3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms