Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rftn1Q6A0D4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms