Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z98

Brsk2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk2Q69Z98 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms