Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnna3Q65CL1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms