Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Sdc3Q64519 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Sdc3Q64519 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Sdc3Q64519 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sdc3Q64519 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Sdc3Q64519 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Sdc3Q64519 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Sdc3Q64519 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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