Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ScxQ64124 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms