Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CochQ62507 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CochQ62507 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CochQ62507 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CochQ62507 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CochQ62507 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CochQ62507 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CochQ62507 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CochQ62507 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CochQ62507 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CochQ62507 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CochQ62507 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CochQ62507 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CochQ62507 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CochQ62507 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CochQ62507 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CochQ62507 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CochQ62507 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CochQ62507 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CochQ62507 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CochQ62507 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CochQ62507 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CochQ62507 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CochQ62507 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CochQ62507 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CochQ62507 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CochQ62507 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CochQ62507 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CochQ62507 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CochQ62507 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CochQ62507 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CochQ62507 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CochQ62507 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CochQ62507 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CochQ62507 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CochQ62507 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CochQ62507 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CochQ62507 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CochQ62507 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CochQ62507 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CochQ62507 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CochQ62507 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CochQ62507 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CochQ62507 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CochQ62507 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CochQ62507 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CochQ62507 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CochQ62507 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CochQ62507 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CochQ62507 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CochQ62507 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CochQ62507 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CochQ62507 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CochQ62507 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CochQ62507 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CochQ62507 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CochQ62507 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CochQ62507 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CochQ62507 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CochQ62507 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CochQ62507 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CochQ62507 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CochQ62507 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CochQ62507 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CochQ62507 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CochQ62507 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CochQ62507 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CochQ62507 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CochQ62507 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CochQ62507 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CochQ62507 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CochQ62507 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CochQ62507 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CochQ62507 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CochQ62507 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CochQ62507 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CochQ62507 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CochQ62507 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CochQ62507 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CochQ62507 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CochQ62507 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CochQ62507 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CochQ62507 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CochQ62507 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CochQ62507 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CochQ62507 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CochQ62507 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CochQ62507 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CochQ62507 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CochQ62507 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CochQ62507 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CochQ62507 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CochQ62507 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CochQ62507 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CochQ62507 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CochQ62507 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CochQ62507 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CochQ62507 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CochQ62507 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CochQ62507 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms