Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms