Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sall3Q62255 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sall3Q62255 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sall3Q62255 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sall3Q62255 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sall3Q62255 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sall3Q62255 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sall3Q62255 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sall3Q62255 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sall3Q62255 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sall3Q62255 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sall3Q62255 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sall3Q62255 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sall3Q62255 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sall3Q62255 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sall3Q62255 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sall3Q62255 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sall3Q62255 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sall3Q62255 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms