Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd180Q62192 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms