Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms