Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

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Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sema3cQ62181 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Sema3cQ62181 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Sema3cQ62181 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Sema3cQ62181 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Sema3cQ62181 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Sema3cQ62181 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Sema3cQ62181 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Sema3cQ62181 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Sema3cQ62181 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Sema3cQ62181 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3cQ62181 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms