Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sema3bQ62177 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sema3bQ62177 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sema3bQ62177 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sema3bQ62177 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema3bQ62177 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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