Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms