Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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PcolceQ61398 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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PcolceQ61398 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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