Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cln3Q61124 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cln3Q61124 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln3Q61124 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln3Q61124 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln3Q61124 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Cln3Q61124 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln3Q61124 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln3Q61124 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Cln3Q61124 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln3Q61124 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Cln3Q61124 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Cln3Q61124 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln3Q61124 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln3Q61124 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln3Q61124 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln3Q61124 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln3Q61124 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln3Q61124 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln3Q61124 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Cln3Q61124 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cln3Q61124 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cln3Q61124 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Cln3Q61124 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Cln3Q61124 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Cln3Q61124 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Cln3Q61124 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cln3Q61124 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms