Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sin3aQ60520 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sin3aQ60520 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sin3aQ60520 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sin3aQ60520 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sin3aQ60520 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sin3aQ60520 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sin3aQ60520 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sin3aQ60520 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sin3aQ60520 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms