Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms