Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms