Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8B9

Frem3, FRAS1-related extracellular matrix protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem3Q5H8B9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Frem3Q5H8B9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Frem3Q5H8B9 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Frem3Q5H8B9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Frem3Q5H8B9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Frem3Q5H8B9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Frem3Q5H8B9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Frem3Q5H8B9 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Frem3Q5H8B9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Frem3Q5H8B9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
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Frem3Q5H8B9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Frem3Q5H8B9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frem3Q5H8B9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frem3Q5H8B9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Frem3Q5H8B9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frem3Q5H8B9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frem3Q5H8B9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Frem3Q5H8B9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frem3Q5H8B9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frem3Q5H8B9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frem3Q5H8B9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frem3Q5H8B9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frem3Q5H8B9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frem3Q5H8B9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frem3Q5H8B9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frem3Q5H8B9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frem3Q5H8B9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frem3Q5H8B9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frem3Q5H8B9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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