Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms