Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms