Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ndufaf2Q59J78 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ndufaf2Q59J78 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ndufaf2Q59J78 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ndufaf2Q59J78 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ndufaf2Q59J78 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ndufaf2Q59J78 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ndufaf2Q59J78 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ndufaf2Q59J78 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ndufaf2Q59J78 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms