Protein–RNA interactions for Protein: Q505D9

Trim67, Tripartite motif-containing protein 67, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim67Q505D9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim67Q505D9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trim67Q505D9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trim67Q505D9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trim67Q505D9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Trim67Q505D9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim67Q505D9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim67Q505D9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim67Q505D9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim67Q505D9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim67Q505D9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim67Q505D9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim67Q505D9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim67Q505D9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim67Q505D9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim67Q505D9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim67Q505D9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim67Q505D9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim67Q505D9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim67Q505D9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim67Q505D9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim67Q505D9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim67Q505D9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim67Q505D9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim67Q505D9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim67Q505D9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim67Q505D9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim67Q505D9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trim67Q505D9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim67Q505D9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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