Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt35Q497I4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms