Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930596D02RikQ3V0H9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms