Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms