Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms