Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms