Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zyg11bQ3UFS0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zyg11bQ3UFS0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zyg11bQ3UFS0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zyg11bQ3UFS0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zyg11bQ3UFS0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zyg11bQ3UFS0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zyg11bQ3UFS0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Zyg11bQ3UFS0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zyg11bQ3UFS0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zyg11bQ3UFS0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zyg11bQ3UFS0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zyg11bQ3UFS0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zyg11bQ3UFS0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zyg11bQ3UFS0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zyg11bQ3UFS0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zyg11bQ3UFS0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zyg11bQ3UFS0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zyg11bQ3UFS0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zyg11bQ3UFS0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zyg11bQ3UFS0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zyg11bQ3UFS0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zyg11bQ3UFS0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zyg11bQ3UFS0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zyg11bQ3UFS0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zyg11bQ3UFS0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zyg11bQ3UFS0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zyg11bQ3UFS0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zyg11bQ3UFS0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zyg11bQ3UFS0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zyg11bQ3UFS0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zyg11bQ3UFS0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zyg11bQ3UFS0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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