Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDP0

Wdr41, WD repeat-containing protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr41Q3UDP0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms