Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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