Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms