Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 225.9 ms