Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD49

Sppl2b, Signal peptide peptidase-like 2B, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2bQ3TD49 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms