Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Ccbe1Q3MI99 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Ccbe1Q3MI99 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Ccbe1Q3MI99 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Ccbe1Q3MI99 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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Ccbe1Q3MI99 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Ccbe1Q3MI99 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Ccbe1Q3MI99 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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