Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Specc1lQ2KN98 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms