Protein–RNA interactions for Protein: Q1HCM0

Fgfbp3, Fibroblast growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfbp3Q1HCM0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Fgfbp3Q1HCM0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Fgfbp3Q1HCM0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Fgfbp3Q1HCM0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Fgfbp3Q1HCM0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Fgfbp3Q1HCM0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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