Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Rpusd3Q14AI6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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